Pues hasta hace poco pensaba que el proyecto más avanzando en conseguir visualizar los subtitulos con efectos en linux era el VLC, que ya empezaba a mostrar los colores, sin embargo, para mi sorpresa, Mplayer ya los muestra a la perfección, solo que no viene activada la opción por defecto.
Para activar dicha opción es necesario añadir el parametro -ass cuando carguemos el fichero y listo!
Si usais interfáz grafica, comprobar si tiene la opción o buscar el comando que usa para llamar a mplayer y añadirlo, en mi caso, uso Kmplayer y para ello debemos hacer lo siguiente:
Preferencias -> Configurar Kmplayer -> Opciones Generales -> Mplayer
Y donde pone Comando mplayer escribir mplayer -ass
En la interfáz básica de Mplayer basta con ir a
Preferences -> Subtitules & OSD
Y marcar la opción SSA/ASS subtitule redering.
Ale, ya teneis vuestros subs con efectos chachis. Lo he probado en los mkv y al menos ahí funciona, supogo que funcionará en mp4 y .ass externos también.
Esperemos que en Xine, Gstreamer y VLC (de forma total) pronto también esté disponible la visualización de los ass y ssa.
Si alguno sabe como activarlo en otra GUI o de algún otro reproductor que soporte los subs, avisad 
